雷克薩斯ES發動機進水 求各路大神指教

本人，生活在一個廣西的小縣城，本來一切順順利利的，遭遇了大雨，對于我這個一點常識都沒有的小孩來說，真是活該，把ES當船用，那里水多，就開去玩水，幾次都可以開過涉水區域，但是準備回家了，當時回頭就不會有事了，偏偏選擇闖過多水地區，到最后熄火了，我還不懂，既然2次啟動，導致連桿歪了，發動機大修換了活塞，開去修理廠 修了1萬多，修好之后，發現發動機加速到2千轉的時候 震動，副駕駛特別明顯，去問過了很多人，有人說需要磨合，有人說三元（查成交價|參配|優惠政策）催化器的問題，搞得我這幾天心情都不好，想徹底修好它，各路大神 救救我這個無知的少年吧，車是2014款的，2015.年買的，換了機腳這些東西 還是沒有根治 真的是需要磨合嗎？